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运行时
GenomeWorks怎么使用
2022-06-02 14:38:07
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我们在公共软件库下面找到了GenomeWorks软件，但是这个目录下面没有src文件，只有一些lib库和cmake文件。在test_case中只找到了一个已有的可运行文件和slurm脚本，请问这个软件具体应该怎么使用呢？src文件在哪呢？怎么生成指定规模的可运行文件呢

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T
tianlh
1楼

您好，这里有一些资料可参考使用https://developer.hpccube.com/gitbook//dcu_developer/OperationManual/4_HPC_Applications/4.6_BiologicalSciences/GenomeWorks/4.6.4.html

2022/6/2
G
ghfund_1_a8
回复 @tianlh

在参考该文档安装时，shell中进行git clone 一直超时，git clone -b rocm-3.9 http://10.0.100.3/dcutoolkit/hpcapps/genomeworks.git

2022/6/4
T
tianlh
回复 @tianlh

您好，安装包已拷贝至您的账号目录下，genomeworks-install-21.04.zip，使用之前请加载dtk21.04的环境，module switch compiler/rocm/dtk-21.04

2022/6/6
G
ghfund_1_a8
回复 @tianlh

您好，我们想要使用GenomeWorks作为我们功能的测试软件，具体来讲就是测试下GenomeWorks能否在相关背景下正常运行，现在编译出的测试程序（也就是在build/install下的程序）比较小，程序运行时间很短，想问下怎么生成比对序列比较大可执行程序呢，现在测试程序时1000条，如果可以的话我们想扩大到100万条测试程序来

2022/6/7
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